श्री माता वैष्णो देवी श्राइन बोर्ड का गठन अगस्त, 1986 में जम्मू और कश्मीर श्री माता वैष्णो देवी श्राइन अधिनियम के प्रावधानों के अंतर्गत हुआ था और अगस्त, 1988 में जम्मू और कश्मीर श्री माता वैष्णो देवी श्राइन अधिनियम के अंतर्गत इसका पुनर्गठन किया गया।
श्री माता वैष्णो देवी की यात्रा का संचालन और व्यवस्था का ध्यान और वहां पर होने वाले चढ़ावे का ध्यान बोर्ड द्वारा रखा जाता है जिसमें एक अध्यक्ष और दस से अधिक सदस्य नहीं होते है। जम्मू और कश्मीर के उपराज्यपाल इस बोर्ड के अध्यक्ष होते हैं। और अगर उपराज्यपाल हिंदू न हो तो वह हिंदू धर्म के किसी प्रसिद्ध व्यक्ति का नाम घोषित कर सकता है।

श्री माता वैष्णो देवी श्राइन बोर्ड अपनी जिम्मेदारियों का निर्वाह मुख्य कार्यकारी अधिकारी के द्वारा करता है। मुख्य कार्यकारी अधिकारी की सहायता के लिए बहुत सारे विभागीय अधिकारी होते हैं।
बोर्ड की वर्तमान संरचना इस प्रकार है:

अध्यक्ष-: श्री मनोज सिन्हा (माननीय उपराज्यपाल, जम्मू कश्मीर)
 

बोर्ड सदस्य: